Рейс JAL516 прилетел в Токио из аэропорта на острове Хоккайдо. Лайнер столкнулся с самолетом службы береговой охраны. По данным The Guardian, самолет должен был доставить груз в аэропорт Ниигаты в рамках оказания помощи пострадавшим от землетрясения.

На борту находились более 300 пассажиров и 12 членов экипажа, все они были эвакуированы и не пострадали.